本实验室有较多的国际合作项目和人员交流途径，并积极主办和参加国内外学术会议。通过广泛的国内外学术交流与合作，活跃了学术气氛，解决了研究工作中的某些关键问题，提高了科研人员的研究水平，扩大了重点实验室在国内外的学术影响，基本形成了“开放、流动、联合、竞争”的良好学术环境。

主要合作单位有美国加州理工学院、南非Witwaterstand大学、美国芝加哥大学、美国地调所、加拿大地调所、加拿大Mcgill大学、加拿大多伦多大学、加拿大Memory大学、加拿大魁北克大学、英国立滋大学、瑞典Gothenburg大学、捷克地调所、香港大学、南京大学和云南省地矿厅等。

主要合作方式包括与国内外有关单位联合申请重要科研项目、外派高级访问学者、合作培养博士生、邀请国内外相关研究领域的知名学者来室进行学术交流等。

举办了“矿床地球化学研究新进展”系列学术研讨会，主办或参与主办了全球性学术讨论会4次，全国性学术讨论会10次。实验室200余人次参加了在北京、南京、贵阳、昆明、西安、西宁、宁波、成都、香港、台湾、日本、美国、俄罗斯、瑞士、希腊、加拿大等地举办的相关研究领域的国际国内学术会议，29人次作了大会特邀报告。

约20人次赴美国、加拿大、英国、南非、德国、捷克、瑞士、香港等国家和地区留学和从事合作研究。同时重点实验室邀请了澳大利亚、法国、美国、捷克、南非、俄罗斯、德国、加拿大、香港等国家和地区近30人次的专家学者来室合作研究和学术交流。

积极邀请国内知名专家到室进行学术交流。中国地科院李廷栋院士、陈毓川院士、毛景文研究员，中国地质大学翟裕生院士，南京大学周新民教授、华仁民教授、马东生教授、朱金初教授、倪培教授，中国科技大学郑永飞教授，北京大学曾怡善教授，中科院广州地球化学所谢先德研究员、范蔚茗研究员，中科院地质与地球物理所翟明国研究员，武警黄金部队总工蒋志中将和有色北京地质矿产研究所王京彬研究员等20余位曾先后应邀来室讲学。

承担了6项双方单位间有正式协议的国际（含香港）合作科研项目、5项云南省-中院院合作项目。目前正在执行的主要国际（含香港）合作项目有：（1）扬子地块内代表性岩浆硫化物矿床的PGE地球化学（国家基金委-香港大学）、剪切带成矿流体与金成矿作用（中科院-加拿大魁北克大学）、东川-易门铜矿带与中非铜矿带的对比研究（国家科技部-南非基金委）、富金属黑色页岩PGE的富集机制和环境效应（中国-捷克科学与技术合作研究项目）。

采取定向支持和自由申请的方式，吸引了来自美国新墨西哥大学、美国明尼苏达大学、加拿大魁北克大学、香港大学、北京大学、南京大学、中山大学、中国地质大学、成都理工大学、中科院广州地化所、中科院长沙大地所等单位的几十位优秀学者，来我室进行开放课题或客座研究。